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探針法實時PCR原理

發(fā)布時間:2013-08-12 閱讀:786

    實時熒光定覺PCR技術(shù)是指在PCR反應體系中加人熒光基團,利用熒光信號積累,實時監(jiān)測整個PCR過程,后通過標準曲線對模板進行定量分析的方法。
    實時熒光定量pcr儀常用的檢測模式有TaqMan/TaqMan MGB探針法和SYBR Green I熒光染料法。
    TaqMan技術(shù)要點是在普通PCR原有的一對特異性引物的基礎(chǔ)上增加了一條特異性的熒光雙標記探針.該探針同樣與核酸特異性結(jié)合.且結(jié)合部位位于引物結(jié)合區(qū)域的中間.探針的5'端和3'端分別標記不同的熒光素,如5'端標記FAM熒光素,它發(fā)出的熒光能夠被檢測儀器接收,稱為報告熒光基團;3'端一般標記TAMRA熒光素,它在近距離內(nèi)能吸收5'端報告熒光基團發(fā)出的熒光信號,稱為淬滅熒光墓團.當PCR反應在退火階段時,一對引物和一條探針同時與目的基因片段結(jié)合,探針位于引物之間。此時探針5'端報告熒光基團發(fā)出的熒光信號被3'端的淬滅熒光基團吸收,儀器檢測不到熒光信號。當PCR反應進行到延伸階段時.Taq酶在引物的引導下,以四種核昔酸為底物,根據(jù)堿基配對的原則.沿著模板鏈合成新鏈。當鏈的延伸進行到探針結(jié)合部位時,受到探針的阻礙而無法繼續(xù).此時的Taq酶發(fā)揮它的5'-3'外切核酸酶的功能,將探針切成單核昔酸,消除阻礙,將鏈延伸過程進行到底,合成新鏈,而被水解的探針.其5'端和3'端的熒光素此時均游離于溶液中,5'端標熒光素發(fā)出的熒光信號不再被3'端的淬滅熒光基團吸收,熒光信號即被儀器接收.PCR進行一個循環(huán),合成了多少條新鏈就水解了多少條探針,釋放了相應數(shù)目的熒光基團,熒光信號的強度與PCR反應產(chǎn)物的量呈對應關(guān)系。隨著PCR過程的進行.重復上述過程, PCR產(chǎn)物呈指數(shù)形式增長,熒光信號也相應增長(圖5-3).
   與上述TaqMan探針相比,TaqMan MGB探針有兩個主要不同:一是探針3'端標記了自身不發(fā)光的淬滅熒光分子,以取代常規(guī)可發(fā)光的TAMRA熒光素標記。這使熒光本底降低.熒光光分辨率得以大大改善。二是探針3'端另結(jié)合T MGB(minor groove binder)結(jié)合物,大大增加了探針的雜交穩(wěn)定性,使結(jié)果、分辨率高。
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